Art Jeffries (Bruce Willis), um renegado agente do FBI, está decidido a combater implacáveis agentes federais para proteger Simon, um garoto autista de nove anos que quebrou códigos indecifráveis do governo. Ele é capaz de ler o sistema Mercury, o mais avançado código criptografado, de maneira tão simples como outras crianças lêem histórias em quadrinhos. A habilidade de Simon mostrou a vulnerabilidade de um código secreto bilionário, especialmente se o mesmo cair nas mãos dos inimigos dos Estados Unidos. O chefe do programa, Nick Kudrow (Alec Baldwin) precisa eliminar a ameaça à segurança, mas não contava com o envolvimento do agente Jeffries. Perseguidos por cruéis assassinos, Jeffries percebe que não pode confiar em ninguém. Agora, o tempo está se esgotando e ele descobre que a única esperança de sobreviver é usar a especialidade de Simon para levar seus adversários até a justiça.